После обновления всплыла новая проблема, перестала работать мышь во всех приложения использующих OpenGL. Заметил это лишь после запуска q3...

Решил проблему пересборкой:

$portmaster libXxf86dga xf86dga xf86dgaproto

Ставим порт:

%sudo make -C /usr/ports/games/linux-doom3

Настраиваем linuxulator

Далее...